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BONSAI (SR0448RR)

Bioinformatics and Sequence Analysis

SEQUOIA2 (SR0422XR) →  BONSAI


Statut: Terminée

Responsable : Hélène Touzet

Mots-clés de "A - Thèmes de recherche en Sciences du numérique - 2023" : Aucun mot-clé.

Mots-clés de "B - Autres sciences et domaines d'application - 2023" : Aucun mot-clé.

Domaine : Santé, biologie et planète numériques
Thème : Biologie numérique

Période : 01/01/2011 -> 31/12/2018
Dates d'évaluation : 17/10/2013 , 11/10/2017

Etablissement(s) de rattachement : CNRS, U. LILLE 1 (USTL)
Laboratoire(s) partenaire(s) : CRISTAL (9189)

CRI : Centre Inria de l'Université de Lille
Localisation : Centre Inria de l'Université de Lille
Code structure Inria : 101030-1

Numéro RNSR : 201120987U
N° de structure Inria: SR0448RR

Présentation

La bio-informatique a connu un développement important ces vingt dernières années pour devenir un domaine de recherche riche et fécond. Cette evolution s'est accompagnée d'innovations en biologie moléculaire concernant les technologies de séquençage, le transcriptome, la protéomique, qui permettent d'accéder à une mine d'informations. Ces données constituent une opportunité inédite d'élucider le fonctionnement du génome et de la cellule. L'objectif principal de BONSAI est de développer des outils pour l'analyse des génomes et des séquences à grande échelle. Cela inclut la définition de modèles combinatoires et d'algorithmes efficaces, la mise en oeuvre dans des logiciels robustes et diffusés, la validation sur des données biologiques. La plupart de nos projets de recherche sont menés en collaboration avec des équipes de recherche de biologie.


Axes de recherche

High-throughput sequence analysis Noncoding RNAs Nonribosomal peptides Genome rearrangements


Relations industrielles et internationales