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BIOCORE (SR0444IR)

Biological control of artificial ecosystems

COMORE (SR0147TR) →  BIOCORE →  MACBES (SR0942UR)


Statut: En cours de fermeture

Responsable : Olivier Bernard

Mots-clés de "A - Thèmes de recherche en Sciences du numérique - 2023" : A1.5.1. Systèmes de systèmes , A6. Modélisation, simulation et contrôle , A6.1.1. Modélisation continue (EDP, EDO) , A6.1.3. Modélisation discrete (multi-agent, individus centrés) , A6.1.4. Modélisation multiéchelle , A6.1.5. Modélisation multiphysique , A6.2.1. Analyse numérique des EDP et des EDO , A6.2.6. Optimisation , A6.4. Automatique , A6.4.1. Contrôle déterministe , A6.4.3. observabilité et contrôlabilité , A6.4.4. Stabilité et stabilisation , A6.4.6. Contrôle optimal , A8.1. Mathématiques discrètes, combinatoire , A8.2. Optimisation , A8.7. Théorie des graphes , A8.11. Théorie des jeux , A9.2. Apprentissage

Mots-clés de "B - Autres sciences et domaines d'application - 2023" : B1.1.7. Biologie computationnelle , B1.1.8. Biologie mathématique , B1.1.10. Biologie des systèmes et biologie synthétique , B2.4.1. Pharmacologie et toxicologie , B3.1. Développement durable , B3.1.1. Gestion des ressources , B3.4. Risques , B3.4.1. Risques naturels , B3.4.2. Risques et déchets industriels , B3.4.3. Pollution , B3.5. Agronomie , B3.6. Ecologie , B3.6.1. Biodiversité , B4.3. Production d'énergie renouvelable , B4.3.1. Biocarburants

Domaine : Santé, biologie et planète numériques
Thème : Modélisation et commande pour le vivant

Période : 01/01/2011 -> 31/12/2024
Dates d'évaluation : 15/10/2013 , 12/10/2017 , 15/05/2022

Etablissement(s) de rattachement : CNRS, INRAE, SORBONNE UNIVERSITE
Laboratoire(s) partenaire(s) : LOV (UMR7093)

CRI : Centre Inria d'Université Côte d'Azur
Localisation : Centre Inria d'Université Côte d'Azur
Code structure Inria : 041010-1
CRI : Centre Inria d'Université Côte d'Azur
Localisation : Laboratoire d'Océanographie de Villefranche-sur-Mer, Station Zoologique
Code structure Inria : 041010-1

Numéro RNSR : 201121226D
N° de structure Inria: SR0444IR

Présentation

L'équipe-projet BIOCORE fait suite à l'EPI COMORE.

BIOCORE est une équipe-projet commune INRIA (Unité de Recherche de Sophia-Antipolis), INRA (sites de Sophia Antipolis et LBE Narbonne) et UPMC/CNRS Laboratoire Océanographique de Villefranche sur mer (LOV).
Le but global de Biocore est de contribuer à préserver l'environnement, en développant de nouvelles sources d'énergie, en évitant la pollution des eaux ou l'utilisation de produits chimiques pour les cultures. Dans cette optique, l'objectif est de concevoir, modéliser, analyser, contrôler et optimiser des écosystèmes artificiels (conçus par l'homme, construits par l'homme, ou profondément modifiés par l'homme).


Axes de recherche

Méthodes mathématiques et informatiques
Nos outils sont ceux de l'analyse des systèmes dynamiques et de la théorie du contrôle, qui inclut la modélisation, l'identification, la validation sur des mesures expérimentales, l'estimation, la régulation, l'optimisation pour des systèmes dynamiques décrits principalement par des équations différentielles ordinaires.

Une approche méthodologique de la biologie
Notre méthodologie reposera sur une approche multi-modèles, en considérant simultanément des modèles fins (de type génétiques ou métaboliques à l'échelle de la cellule ou d'interaction directe entre individus), des modèles à l'échelle de la population et des modèles à l'échelle de l'écosystème (incluant donc plusieurs populations simultanément et leurs interactions avec leur biotope).

Applications

  • les bioénergies, en particulier la production de lipide (pouvant servir de biocarburant), de méthane et d'hydrogène, par des microorganismes (en collaboration avec le LOV et le LBE)
  • la fixation du CO2, en particulier par des micro-algues, dans le but de capter des flux de CO2 industriels (en collaboration avec le LOV). Ce thème peut aussi inclure des dispositifs artificiels développés pour affiner les prédictions des flux de carbone entre l'océan et l'atmosphère.
  • l'épuration biologique dans des bioréacteurs par des microorganismes, afin de diminuer les rejets polluants (en collaboration avec le LBE)
  • l'optimisation de la culture sous serres, en particulier la lutte biologique dans les serres de culture, afin de diminuer l'usage des produits chimiques (en collaboration avec URIH), et la culture des microalgues en photobioréacteur (en collaboration avec le LOV)

Relations industrielles et internationales

  • Collaboration avec LOV CNRS/UPMC Villefranche, IFREMER (Nantes), INRA (MIA Montpellier, LBE Narbonne, GMPA Grignon, ISA Sophia-Antipolis), CIRAD Montpellier, Centre d'Océanologie de Marseille, LOCEAN (Paris), GIPSA Grenoble, équipes INRIA IBIS, ANGE, DYLISS.
  • Université Catholique de Louvain (Belgique), Université de Marrakech (Maroc), Faculté Polytechnique de Mons (Belgique), Université de Stuttgart (Allemagne), Rutgers University (USA)
  • Projet ANR Facteur4.
  • ANR Bioinformatique RESET
  • Projet ANR Funfit
  • Projet ANR Phycover
  • Projet ANR ICycle
  • Projet ITE-Opale
  • Projet ANR Controle-AB
  • Projet ANR PhotoBiofilm Explorer