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AMIB (SR0436BR)

Algorithmes et modèles pour la Biologie Intégrative

AMIB (SR0318HR) →  AMIB →  AMIBIO (SR0781CR)


Statut: Terminée

Responsable : Mireille Regnier

Mots-clés de "A - Thèmes de recherche en Sciences du numérique - 2023" : Aucun mot-clé.

Mots-clés de "B - Autres sciences et domaines d'application - 2023" : Aucun mot-clé.

Domaine : Santé, biologie et planète numériques
Thème : Biologie numérique

Période : 01/01/2011 -> 31/12/2016
Dates d'évaluation : 17/10/2013 , 11/10/2017

Etablissement(s) de rattachement : U. PARIS 11 (P.-SUD), CNRS, EC. POLYTECHNIQUE
Laboratoire(s) partenaire(s) : LIX (UMR7161)

CRI : Centre Inria de Saclay
Localisation : Laboratoire d'Informatique de l'Ecole polytechnique
Code structure Inria : 111051-1

Numéro RNSR : 201120772K
N° de structure Inria: SR0436BR

Présentation

AMIB poursuit 3 buts biologiques principaux.

  • les modèles structuraux pour les ARN et les protéines, leurs interactions et le design
  • les stratégies d'annotation structurelle et fonctionnelle des séquences;
  • biologie des systèmes.

La modélisation et l'annotation se basent sur des algorithmes combinatoires, l'énumération et les probabilités. L'apprentissage et les méthodes d'extraction de connaissance sont aussi adaptés. Le développement de critères quantitatifs rigoureux pour évaluer la qualité des prédictions est au coeur de ce projet.


Axes de recherche


Relations industrielles et internationales

Collaborations en cours avec des universitaires et chercheurs de : MPI-Berlin, Boston College, UQAM-Montreal, McGill, UPenn, Stanford.